新疆自治区中医院是一所集医疗教学科研预防保健为一体的综合性中医医疗机构1956年4月经自治区卫生厅批准在新疆公费医疗门诊部的基础上成立了自治区中医门诊部;

1959年7月1日正式挂牌成立新疆维吾尔自治区中医医院;1986年4月在保留新疆维吾尔自治区中医医院名称的同时又挂牌成为新疆中医学院附属医院;1998年9月新疆医科大学成立以后更名为新疆医科大学附属中医医院2001年11月医院与中医研究所顺利合并经自治区编委批准挂有五块牌子即：新疆维吾尔自治区中医医院新疆维吾尔自治区中医药研究院新疆医科大学附属中医医院新疆医科大学第四临床医学院和新疆中医名医名方研究开发中心医院现有在职职工938人(不包括合同工临时工)行政管理人员29人工人97人(含商业联办划转职工)专业技术人员812人其中正高职称专业技术人员48人副高职称专业技术人员115人中级职称专业技术人员304人医院现设有一个分院(开发区医院)三个门诊部(黄河路门诊部大十字门诊部幸福路门诊部)和一个戒毒康复中心