上海交通大学医学院附属新华医院(原上海第二医科大学附属新华医院)创建于1958年，是新中国诞生后在上海兴建的首家综合性教学医院。近五十年来，新华人以治病救人、诚信服务、树立良好公众形象为突破口，以改善服务、规范医疗行为为工作重心，在全社会的关心下，通过全体员工的励精图治，医院管理不断优化，医疗水平不断提高，医疗业务不断攀升，服务意识不断增强，教学科研不断进步，医院环境不断美化，使医院成为一所专业特色显著、学科门类齐全，集医疗、教学、科研于一体的特大型、综合性教学医院。1993、1995年分别被国家卫生部授予三级甲等医院和爱婴医院称号。80年代以来，三次荣获全国先进集体称号，七次被评为上海市文明单位。

医院拥有两个临床基地：新华院本部和上海儿童医学中心;拥有四所市级研究机构：上海市儿科医学研究所、上海市小儿先天性心脏病研究所、上海市发育生物学重点研究室和上海市环境与儿童健康重点实验室;拥有两个上海市临床医学中心：小儿心血管病临床医学中心和小儿外科畸形矫治临床医学中心;拥有上海交通大学医学院的三个分支医学院：儿科医学院、新华临床医学院和儿科继续教育医学院;还拥有新华医疗开发公司、新华泛亚医疗投资管理有限公司和上海康欣假肢厂。近年来，通过对医疗市场的细致分析，医院作为核心医院与上海交通大学医学院附属宝钢医院、崇明堡镇人民医院共同组建了的新华医院集团;并在各级领导的关心下，尤其在杨浦区区委、区府和区卫生局的大力支持下，杨浦区中心医院已成为医院的分院。2006年，医院在上海交通大学及医学院、上海市卫生局和上海申康医院发展中心的领导下，全面贯彻落实科学发展观，齐心协力建设和谐医院，以强化内部管理为抓手，切实落实整改医院管理年活动市级督查反馈问题;举办首期“新华医院医院管理课程高级研修班”，提高中层干部执行力;认真完善院长接待日开设、院长意见箱开取、医院网站院长信箱开通的“三开”制度，畅通院领导与普通病人的沟通渠道;积极发挥三级质量控制网络的作用，坚持每季度在院周会上反馈医疗质量控制检查结果和开展医疗质量专题讲评，取得明显的效果，医疗服务显著改善，使得医院在市级医院管理年督查活动的19所综合医院中的排名比去年提前了三分之一，实现了“十一五”时期的良好开局。